ARN y genes largos no codificantes expresados en la enfermedad de Parkinson

La enfermedad de Parkinson (EP) es un trastorno neurodegenerativo del movimiento común, pero la patogénesis sigue siendo difícil de alcanzar. Este estudio tuvo como objetivo explorar genes clave y ARN largos no codificantes (lncRNAs) asociados con la EP.
Se incluyeron tres pacientes con EP y tres controles normales en el presente estudio desde el 12 de julio de 2017 hasta el 29 de agosto de 2017. Se realizaron análisis de secuenciación de ARN y bioinformática para obtener micro ARN expresados diferencialmente (ARNmc) y ARNnc (ARNmc) ) entre pacientes con EP y controles normales. Se construyeron redes de interacción proteína-proteína específicas de la EP. Se realizaron búsquedas de DEmRNAs transcritos dentro de una ventana de 100 kb en sentido ascendente o descendente de DElncRNAs, que se definieron como DEmRNAs dirigidos a cis cercanos de DElncRNAs. Los conjuntos de datos GSE57475 y GSE68719 se descargaron de la base de datos Gene Expression Omnibus, que se utilizaron para validar la expresión de los ARNm seleccionados.
Se obtuvieron un total de 857 DEmRNAs y 77 DElncRNAs entre PD y controles normales. La citotoxicidad mediada por células asesinas naturales fue una vía significativamente enriquecida en la EP. ERBB2, HSPB1 y MYC fueron tres proteínas centrales de la red de interacción proteína-proteína específica de PD. LOC105378701-TAL1, LOC102724104-CX3CR1, LOC105375056-TREML1 / TREML4, LOC105379392-ANK1, y LOC101928100-KLRK1 / KLRD1 se identificaron interacciones DElncRNA cerca de DEmRNA apuntado en la PD. Los resultados de la expresión génica validados por GSE57475 y GSE68719 fueron consistentes con nuestros resultados de secuenciación de ARN, en general.
Este estudio presente identificó genes clave y lncRNAs asociados con la EP, que proporcionarán nuevas pistas para explorar la patogénesis y desarrollar biomarcadores potenciales de la EP.

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