Autor/autores:
Zhou Y, Gu C, Li J, Zhu L (er.al)
La enfermedad de Parkinson (EP) es un trastorno neurodegenerativo del movimiento común, pero la patogénesis sigue siendo difícil de alcanzar. Este estudio tuvo como objetivo explorar genes clave y ARN largos no codificantes (lncRNAs) asociados con la EP.Se incluyeron tres pacientes con EP y tres controles normales en el presente estudio desde el 12 de julio de 2017 hasta el 29...
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La enfermedad de Parkinson (EP) es un trastorno neurodegenerativo del movimiento común, pero la patogénesis sigue siendo difícil de alcanzar. Este estudio tuvo como objetivo explorar genes clave y ARN largos no codificantes (lncRNAs) asociados con la EP.
Se incluyeron tres pacientes con EP y tres controles normales en el presente estudio desde el 12 de julio de 2017 hasta el 29 de agosto de 2017. Se realizaron análisis de secuenciación de ARN y bioinformática para obtener micro ARN expresados diferencialmente (ARNmc) y ARNnc (ARNmc) ) entre pacientes con EP y controles normales. Se construyeron redes de interacción proteína-proteína específicas de la EP. Se realizaron búsquedas de DEmRNAs transcritos dentro de una ventana de 100 kb en sentido ascendente o descendente de DElncRNAs, que se definieron como DEmRNAs dirigidos a cis cercanos de DElncRNAs. Los conjuntos de datos GSE57475 y GSE68719 se descargaron de la base de datos Gene Expression Omnibus, que se utilizaron para validar la expresión de los ARNm seleccionados.
Se obtuvieron un total de 857 DEmRNAs y 77 DElncRNAs entre PD y controles normales. La citotoxicidad mediada por células asesinas naturales fue una vía significativamente enriquecida en la EP. ERBB2, HSPB1 y MYC fueron tres proteínas centrales de la red de interacción proteína-proteína específica de PD. LOC105378701-TAL1, LOC102724104-CX3CR1, LOC105375056-TREML1 / TREML4, LOC105379392-ANK1, y LOC101928100-KLRK1 / KLRD1 se identificaron interacciones DElncRNA cerca de DEmRNA apuntado en la PD. Los resultados de la expresión génica validados por GSE57475 y GSE68719 fueron consistentes con nuestros resultados de secuenciación de ARN, en general.
Este estudio presente identificó genes clave y lncRNAs asociados con la EP, que proporcionarán nuevas pistas para explorar la patogénesis y desarrollar biomarcadores potenciales de la EP.
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