Resumen
Las deficiencias cognitivas son una característica central en pacientes con esquizofrenia. Estas deficiencias podrían servir como herramientas eficaces para la comprensión de la arquitectura genética de la esquizofrenia. Este estudio investigó si las variantes genéticas asociadas con alteraciones cognitivas se agregan en las redes de genes funcionales relacionadas con la patogénesis de la esquizofrenia. Aquí, se realizaron estudios de asociación de genoma completo (GWAS) de una gama de fenotipos cognitivos relacionados con la esquizofrenia en 411 sujetos sanos. Hemos tratado de replicar los datos GWAS utilizando 257 pacientes con esquizofrenia y se realizó un meta-análisis de los resultados GWAS y de los resultados replicados. Debido a que las redes de genes, en lugar de un solo gen o variante genético, pueden estar fuertemente asociadas con la susceptibilidad a la esquizofrenia y los deterioros cognitivos, se realizó un análisis de la red genética para los genes próximos a las variantes replicadas. Hemos observado asociaciones nominales entre 3.054 variantes y fenotipos cognitivos en un umbral de p <1,0 × 10- 4. De las 3.054 variantes, las asociaciones de 191 variantes se replicaron en las muestras de replicación (P <0,05). Sin embargo, ninguna variante alcanzó significación para todo el genoma en el metanálisis (P> 5,0 × 10- 8). Además, 115 de 191 polimorfismos de nucleótido único (SNP) replicados tuvieron genes situados dentro de los 10 kb de los SNP (60,2%). Estas variantes estuvieron moderadamente asociadas con fenotipos cognitivos que iban desde P = 2,50 × 10 5 a P = 9,40 × 10- 8. Los genes situados dentro de los 10 kb de los SNP replicados fueron agrupados de manera significativa en términos de actividad del receptor de glutamato (tasa de falso descubrimiento (FDR) q = 4,49 × 10- 17) y del sistema inmunológico relacionado con mayor de histocompatibilidad en redes de clase compleja I (FDR q = 8,76 × 10- 11). Nuestros resultados demuestran que las variantes genéticas relacionadas con el deterioro del rasgo cognitivo en la esquizofrenia están involucradas en la red de glutamato N-metil-D-aspartato.
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