Análisis exhaustivo del estrés del retículo endoplásmico y la infiltración inmunitaria en el trastorno depresivo mayor

Autor/autores: Zhang J, Xie S, Chen Y...(et.al)

Antecedentes El trastorno depresivo mayor (MDD, por sus siglas en inglés) es una afección de salud mental debilitante y potencialmente mortal. Un factor importante en el desarrollo de la depresión es el estrés del retículo endoplásmico (ERS). Sin embargo, sus roles en MDD aún no se han establecido. El objetivo de este estudio fue examinar ERS y sus...

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Antecedentes

El trastorno depresivo mayor (MDD, por sus siglas en inglés) es una afección de salud mental debilitante y potencialmente mortal. Un factor importante en el desarrollo de la depresión es el estrés del retículo endoplásmico (ERS). Sin embargo, sus roles en MDD aún no se han establecido. El objetivo de este estudio fue examinar ERS y sus mecanismos moleculares subyacentes en MDD.

Métodos

Utilizamos datos de dos conjuntos de datos de micromatrices (GSE98793 y GSE39653) y la base de datos GeneCards para examinar los genes expresados diferencialmente relacionados con el estrés del retículo (ERSR-DEG) asociados con MDD.

Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) y Gene Set Variation Analysis (GSVA) se utilizaron para investigar más a fondo la función y el mecanismo de ERS en MDD.

Además, construimos redes de interacción proteína-proteína (PPI) para identificar genes centrales, así como la red reguladora de microARN (miARN), factores de transcripción (TF) y posibles fármacos relacionados con ERSR-DEG. A continuación, se utilizó CIBERSORT para evaluar la actividad inmunitaria de las muestras de MDD y realizar un análisis de correlación entre los genes centrales y las células inmunitarias.

Resultados

En total, se identificaron 37 ERSR-DEG y cinco genes hub (NCF1, MAPK14, CASP1, CYBA y TNF). El análisis de enriquecimiento funcional reveló que los ERSR-DEG estaban predominantemente enriquecidos en las vías relacionadas con la inflamación y la inmunidad, como la señalización del factor de necrosis tumoral, la señalización de NF-κB y las vías de señalización del receptor tipo Toll.

Además, se probaron 179 miARN, 25 TF y 15 fármacos potenciales para determinar sus interacciones con los ERSR-DEG. CIBERSORT encontró altas proporciones de Tregs, monocitos y macrófagos M0 en las muestras de MDD. Entre estos, los genes hub mostraron una correlación significativa con la infiltración de células inmunitarias en pacientes con MDD.

Conclusiones

NCF1, MAPK14, CASP1, CYBA y TNF son biomarcadores potenciales relacionados con ERS para el diagnóstico de MDD.

Nuestra investigación ha revelado una correlación significativa entre las células inmunitarias y los genes relacionados con ERS con MDD. Nuestro estudio no solo contribuyó a una mejor comprensión de los mecanismos reguladores de ERS en la patología MDD subyacente, sino que también estableció un paradigma para futuros estudios sobre ERS.

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