Autor/autores:
Hollingsworth EW; Vaughn JE; Orack JC...(et.al)
El modelado de enfermedades con células madre pluripotentes inducidas (iPSCs) está creando una abundancia de información fenotípica que se ha vuelto difícil de seguir e interpretar. Aquí, informamos un análisis sistemático de las prácticas de investigación y el sesgo de información en modelos de enfermedades neuroló...
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El modelado de enfermedades con células madre pluripotentes inducidas (iPSCs) está creando una abundancia de información fenotípica que se ha vuelto difícil de seguir e interpretar. Aquí, informamos un análisis sistemático de las prácticas de investigación y el sesgo de información en modelos de enfermedades neurológicas de 93 artículos publicados. Encontramos heterogeneidad en las prácticas de investigación actuales y un sesgo de informe hacia ciertas enfermedades. Además, identificamos 663 fenotipos derivados de células CNS de 243 pacientes y 214 controles, que variaron por tipo de mutación y etapa de desarrollo in vitro Agrupamos estos fenotipos en una taxonomía y caracterizamos estas relaciones fenotipo-genotipo para generar un mapa fenogenético que revela nuevas correlaciones entre genes previamente no relacionados. También encontramos que las alteraciones en los perfiles moleculares derivados de pacientes asociados con fenotipos celulares y genes desregulados muestran una expresión predominante en regiones cerebrales con patología. Por último, desarrollamos el atlas de proyecto de mapas fenogenéticos de células iPS (iPhemap), una base de datos abierta y en línea para catalogar continuamente los fenotipos de enfermedades. En general, nuestros hallazgos ofrecen nuevos conocimientos sobre la fenogenética de los modelos derivados de iPSC, mientras que nuestra herramienta web proporciona una plataforma para que los investigadores consulten y depositen información fenotípica de enfermedades neurológicas.
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