Cambios en los componentes moleculares de la inmunidad innata se encuentran asociados con la activación de la respuesta inflamatoria. Esto se asocia con un aumento extracelular de PRRs solubles y expresión anormal de PPRs unidos a membrana y PRRs citoplasmáticos. La activación de la respuesta inmune innata se refleja en un aumento de citoquinas proinflamatorias en suero y LCR. Cambios en los componentes de la inmunidad se asocian con un aumento en los niveles de anticuerpos contra T. gondii y otros patógenos y un aumento de la prevalencia de anticuerpos anti-NMDAR y anti-gluten. La disbiosis y el aumento de la permeabilidad intestinal están asociados con anticuerpos naturales contra bacterias gramnegativas y LPS.Anomalías en el componente celular de la inmunidad innata se asocian con niveles aumentados de células NK, neutrófilos, monocitos, macrófagos y activación de la microglía. Se caracterizan los componentes celulares de la inmunidad adaptativa por el aumento de linfocitos CD3+ y CD4+ y linfocitos T en el LCR. Aunque los cambios cuantitativos en las células son dentro de los valores de referencia, todos estos indican la activación del sistema inmune periférico. Esto a su vez promueve la neuroinflamación, que conduce a alteraciones cognitivas y neuroanatómicas.Sin embargo solo un cierto subtipo (30 a 50% de todos los pacientes) exhibe un fenotipo inflamatorio.Por lo tanto, la esquizofrenia se acompaña de anomalías en todos los componentes del sistema inmunológico.