Autor/autores:
Andrew E. Jaffe, Daniel J. Hoeppner, Takeshi Saito...(et.al)
Las poblaciones de células específicas pueden tener contribuciones únicas a la esquizofrenia, pero pueden pasarse por alto en los estudios de tejido homogeneizado. Aquí se utilizó microdisección de captura con láser seguida de secuenciación de ARN (LCM-seq) para perfilar transcriptómicamente la capa de células granulares del g...
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Las poblaciones de células específicas pueden tener contribuciones únicas a la esquizofrenia, pero pueden pasarse por alto en los estudios de tejido homogeneizado.
Aquí se utilizó microdisección de captura con láser seguida de secuenciación de ARN (LCM-seq) para perfilar transcriptómicamente la capa de células granulares del giro dentado (DG-GCL) en el hipocampo humano y contrastar estos datos con los obtenidos del homogenado de hipocampo en masa.
Identificamos efectos genéticos y de envejecimiento enriquecido de tipo celular generalizado en el DG-GCL que estaban ausentes o direccionalmente discordantes en los datos de hipocampo en masa. De los ~ 9 millones de loci de rasgos cuantitativos de expresión identificados en el DG-GCL, el 15% no se detectaron en el hipocampo a granel, incluidas 15 variantes de riesgo de esquizofrenia. Creamos pesos genéticos del estudio de asociación de todo el transcriptoma a partir de la DG-GCL, que identificó muchas señales genéticas asociadas a la esquizofrenia que no se encuentran en los estudios de asociación de todo el transcriptoma del hipocampo en masa, incluidos GRM3 y CACNA1C.
Estos resultados destacan la resolución biológica mejorada proporcionada por estrategias de muestreo específicas como LCM y complementan los enfoques homogeneizado y de un solo núcleo en el cerebro humano.
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